Guard Post 506 mengangkat kisah teror yang menyelimuti 20 orang penghuni bungker tua di perbatasan Korea Utara dan Selatan. Bungker tua tersebut tiba-tiba menjadi pusat perhatian setelah semua penghuninya yang berjumlah 20 prajurit ditemukan tewas secara misterius dengan luka parah, hanya satu orang yang selamat dalam peristiwa mengerikan itu, namun dalam kondisi tidak sadarkan diri. Pasukan militer yang kemudian datang untuk mengungkap kasus ganjil ini harus menemui jalan buntu karena tidak adanya saksi mata